В своем знаменитом трактате «Филиппины через сто лет» (1889–1890) Хосе Рисаль проводит глубокий исторический и политический анализ филиппинского общества под властью Испании. Автор утверждает, что колониальная система, основанная на угнетении, невежестве и подавлении прав местного населения, исчерпала себя. Рисаль доказывает, что филиппинцы, несмотря на столетия колонизации, сохранили свою идентичность и стремление к прогрессу. Он предупреждает испанское правительство: если не будут проведены радикальные реформы — предоставление свободы печати, представительство в кортесах и обеспечение справедливого правосудия, — то конфликт между метрополией и колонией станет неизбежным и кровавым.
Рисаль опирается на пророчество немецкого путешественника Феодора Ягора, предсказавшего, что Филиппины не смогут вечно оставаться в изоляции и неизбежно попадут под влияние других мировых держав, в частности США. Автор подчеркивает, что независимость Филиппин — это историческая необходимость, продиктованная законами развития народов. В книге также представлены дополнительные материалы: защита Рисаля перед военным трибуналом, его прощальное обращение к соотечественникам и лирические стихи, раскрывающие его патриотические идеалы. Трактат остается важнейшим документом, определившим идеологию филиппинского национально-освободительного движения и демонстрирующим прозорливость Рисаля как мыслителя, предвидевшего крах колониальной эпохи и становление суверенного филиппинского государства.